33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6425 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  313  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2938  hypothetical protein  51.4 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  39.72 
 
 
171 aa  97.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1163  hypothetical protein  40.67 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  40.34 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3029  hypothetical protein  42.34 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1449  hypothetical protein  40.19 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  39.29 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  35.2 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2876  putative transmembrane protein  46.58 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000745882  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  42.61 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  39.44 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3045  hypothetical protein  31.2 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3104  hypothetical protein  31.2 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3698  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.309374  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14880  hypothetical protein  38.89 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3061  hypothetical protein  31.2 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130056  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  34.13 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11632  hypothetical protein  34.19 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.079961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5672  hypothetical protein  33.93 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2234  hypothetical protein  29.63 
 
 
221 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0129  hypothetical protein  35.19 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0704993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  30.99 
 
 
200 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  32.85 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2821  hypothetical protein  43.86 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.650851  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1988  hypothetical protein  39.22 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  30.22 
 
 
222 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  32.89 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0848  hypothetical protein  29.85 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.276759 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1720  hypothetical protein  27.47 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000883152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4905  hypothetical protein  34.04 
 
 
140 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.159227  hitchhiker  0.00546227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0231  hypothetical protein  35.09 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3461  hypothetical protein  43.48 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>