41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4509 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4509  cytosolic protein  100 
 
 
95 aa  196  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.190159 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3088  hypothetical protein  48.91 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0808  hypothetical protein  41.76 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4404  hypothetical protein  44.71 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1810  hypothetical protein  34.83 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.977987  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4873  hypothetical protein  47.56 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2293  hypothetical protein  41.76 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2619  hypothetical protein  43.18 
 
 
100 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.861714  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3781  hypothetical protein  46.24 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3473  hypothetical protein  46.24 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0672  hypothetical protein  42.55 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11010  hypothetical protein  38.2 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3671  hypothetical protein  45.16 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1009  hypothetical protein  39.08 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3054  hypothetical protein  45.16 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0812076  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3078  hypothetical protein  42.22 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4059  hypothetical protein  38.46 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5985  hypothetical protein  43.75 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3764  hypothetical protein  37.36 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.211886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4020  hypothetical protein  38.46 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79512  normal  0.606869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5303  hypothetical protein  43.96 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0686913  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4263  hypothetical protein  38.95 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2008  hypothetical protein  43.96 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3110  hypothetical protein  42.55 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3805  hypothetical protein  41.11 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3528  hypothetical protein  36.84 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3650  hypothetical protein  41.3 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0800  hypothetical protein  30.77 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.662726  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1687  hypothetical protein  34.88 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3948  hypothetical protein  38.04 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789075  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11520  hypothetical protein  32.61 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.407986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4274  hypothetical protein  35.87 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1278  hypothetical protein  41.3 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0196743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1408  hypothetical protein  33.68 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1243  hypothetical protein  41.3 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.061357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5850  hypothetical protein  38.32 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4084  hypothetical protein  39.36 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000391482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1913  hypothetical protein  39.13 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602401  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0995  hypothetical protein  28.72 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000808008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0880  hypothetical protein  32.04 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.353091  normal  0.692775 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0104  hypothetical protein  28.12 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.742134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>