17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3276 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3276  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0562  hypothetical protein  60.43 
 
 
294 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11170  hypothetical protein  54.11 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0898011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0282  hypothetical protein  51.37 
 
 
294 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6168  hypothetical protein  48.29 
 
 
291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132354  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6450  hypothetical protein  36.36 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0170653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1075  hypothetical protein  33.56 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5087  hypothetical protein  34.49 
 
 
296 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.692279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4541  hypothetical protein  32.57 
 
 
304 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3163  hypothetical protein  30.51 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0045094  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5307  hypothetical protein  32.27 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522562  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13860  hypothetical protein  29.39 
 
 
286 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1177  hypothetical protein  32.75 
 
 
305 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2014  hypothetical protein  26.67 
 
 
314 aa  52.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1564  hypothetical protein  34.78 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.234397  normal  0.812381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2209  hypothetical protein  24.49 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000355617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2159  hypothetical protein  25 
 
 
313 aa  42.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.290579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>