48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3214 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3214  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000452216  hitchhiker  0.0000000474074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8843  hypothetical protein  59.41 
 
 
215 aa  234  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.158291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0432  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.2 
 
 
211 aa  228  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2716  hypothetical protein  54.77 
 
 
204 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2211  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.36 
 
 
265 aa  98.6  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.392669  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3214  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.77 
 
 
277 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000855792  normal  0.159914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2052  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.46 
 
 
138 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.842309  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4296  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.9 
 
 
138 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2051  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.34 
 
 
140 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.622827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1945  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.16 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869019  hitchhiker  0.00300875 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4416  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.28 
 
 
140 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.27 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.254245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.63 
 
 
141 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.129026 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.55 
 
 
139 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.728322  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2656  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.35 
 
 
140 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.859771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.14 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3083  glyoxalase family protein  37.5 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.98 
 
 
140 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610434  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3728  glyoxalase family protein  38.36 
 
 
142 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1215  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.88 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.743705  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.29 
 
 
143 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.392689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2320  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.23 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4182  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.66 
 
 
144 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2492  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.82 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2623  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.35 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0294662  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2927  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
155 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219194  normal  0.368247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6552  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.46 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2449  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0107  hypothetical protein  36.67 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4026  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.94 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.31 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1583  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.31 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.89 
 
 
140 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0156  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.89 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312185  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1560  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.31 
 
 
157 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316717  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4084  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.64 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484555  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3444  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4461  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.9 
 
 
153 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4721  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
157 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4548  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.9 
 
 
153 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162463  normal  0.621639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.85 
 
 
139 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747908  normal  0.224219 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6100  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.38 
 
 
140 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1723  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.14 
 
 
153 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4843  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.46 
 
 
164 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5027  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
153 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.57 
 
 
143 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.243786  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1769  glyoxalase family protein  41.07 
 
 
158 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0233602  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4221  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 
140 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.224785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>