29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2234 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2234  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  46.76 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  41.52 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  39.34 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  37.37 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  30.47 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  34.82 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  34.88 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14880  hypothetical protein  34.04 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11632  hypothetical protein  32.03 
 
 		 132 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.079961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0231  hypothetical protein  40.91 
 
 		 114 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  33.85 
 
 		 136 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4905  hypothetical protein  35.06 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.159227  hitchhiker  0.00546227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3029  hypothetical protein  28.93 
 
 		 127 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2938  hypothetical protein  33.64 
 
 		 145 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5672  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3698  hypothetical protein  36 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.309374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  30.97 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0129  hypothetical protein  28.3 
 
 		 139 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0704993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3061  hypothetical protein  28.33 
 
 		 137 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130056  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3034  hypothetical protein  37.8 
 
 		 113 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000905882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2821  hypothetical protein  34.65 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.650851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  30.43 
 
 		 141 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3104  hypothetical protein  28.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3045  hypothetical protein  28.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1398  hypothetical protein  37.74 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1163  hypothetical protein  36.11 
 
 		 154 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>