30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1804 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1804  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  225  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1190  hypothetical protein  55.93 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3420  hypothetical protein  44.05 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  50.82 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0934  hypothetical protein  62 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.860281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  48.28 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3797  hypothetical protein  42.47 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  39.18 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2357  hypothetical protein  59.09 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1677  hypothetical protein  40.85 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.989943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0980  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0299177  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04280  hypothetical protein  48.15 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6840  secreted protein  50 
 
 
103 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13830  hypothetical protein  46.03 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381398  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6639  hypothetical protein  36.36 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1937  hypothetical protein  53.66 
 
 
61 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20896  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1316  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17500  hypothetical protein  28.7 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1296  hypothetical protein  46.3 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6546  hypothetical protein  42.31 
 
 
100 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240638  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3451  hypothetical protein  58.97 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3503  hypothetical protein  58.97 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138277  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3440  hypothetical protein  58.97 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.110215  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3221  hypothetical protein  40 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0124684  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26160  hypothetical protein  30.65 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12366  hypothetical protein  51.28 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2724  hypothetical protein  51.28 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3199  hypothetical protein  47.5 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000230213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3812  hypothetical protein  51.28 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.285278  normal  0.456235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>