11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6381 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6381  mobilisation protein  100 
 
 		 133 aa  267  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9807  mob protein  76.86 
 
 		 133 aa  192  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4552  mobilisation protein  48.12 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4767  mobilisation protein  48.12 
 
 		 160 aa  123  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153119  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4165  hypothetical protein  47.11 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.14726  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2791  mobilization protein  36.17 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010485  EcSMS35_B0003  mobilization protein MbeC  35.37 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2323  mobilisation protein  36.08 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0027  mobilization protein  26.97 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.99589  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19040  hypothetical protein  36.25 
 
 		 136 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0646668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0782  mobilisation protein  26.79 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816162  normal  0.135002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>