13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5629 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5629  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6947  hypothetical protein  64.25 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0858  hypothetical protein  55.19 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2610  hypothetical protein  50.24 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0781  hypothetical protein  51.78 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3199  hypothetical protein  37.04 
 
 		 453 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3495  hypothetical protein  38.67 
 
 		 452 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1177  hypothetical protein  39.88 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0524  hypothetical protein  32.66 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0334613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30470  hypothetical protein  36.07 
 
 		 568 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5217  hypothetical protein  32.61 
 
 		 437 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02660  hypothetical protein  38.2 
 
 		 431 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.43 
 
 		 702 aa  62.4  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>