56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2251 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  186  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  74.39 
 
 		 86 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  73.17 
 
 		 86 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  73.17 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  69.77 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  69.77 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  59.8 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  64.37 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  60.92 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  62.96 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  55.32 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  61.73 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  60.49 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  56.32 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  53.93 
 
 		 88 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  53.75 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  58.82 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  55.17 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  52.94 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  60.76 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  55.95 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  55.7 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  48.24 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  48.24 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  52.5 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  53.33 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  52 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  52.7 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  49.33 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  50.67 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  49.33 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  51.96 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  49.33 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  46.67 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  46.05 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  43.9 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  45.45 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03656  hypothetical protein  39.76 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  44.59 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2004  hypothetical protein  32.53 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  48.65 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2138  hypothetical protein  40.26 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3099  hypothetical protein  39.24 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2020  protein of unknown function DUF526  37.21 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.271189  normal  0.774588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2390  hypothetical protein  37.21 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3279  hypothetical protein  39.74 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0289  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00075  hypothetical protein  34.67 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0596  protein of unknown function DUF526  39.02 
 
 		 83 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0215  hypothetical protein  39.06 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.739571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6031  hypothetical protein  41.27 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3773  protein of unknown function DUF526  34.25 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69820  hypothetical protein  39.68 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.240173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0356  hypothetical protein  44.19 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0069  hypothetical protein  35.9 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0117434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>