25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2239 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2239  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  51.41 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  61.21 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  55.83 
 
 		 155 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1466  hypothetical protein  50.94 
 
 		 170 aa  94  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  37.74 
 
 		 210 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1516  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  90.1  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1649  hypothetical protein  49.09 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.989787  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0987  hypothetical protein  39.71 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.283754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  65.38 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2438  hypothetical protein  65.38 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  61.54 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  44.74 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  57.69 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  47.62 
 
 		 235 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  57.69 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3014  hypothetical protein  65.38 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12196  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  53.85 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  60 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7094  hypothetical protein  34.13 
 
 		 119 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  57.69 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  43.33 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  57.69 
 
 		 196 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  53.85 
 
 		 201 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>