9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1905 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1905  GcrA cell cycle regulator  100 
 
 		 144 aa  298  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4846  hypothetical protein  80.39 
 
 		 87 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0233565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1228  GcrA cell cycle regulator  33.99 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0613007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0757  hypothetical protein  43.64 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  32.47 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0696  hypothetical protein  38.89 
 
 		 98 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0484  hypothetical protein  36.84 
 
 		 183 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1656  hypothetical protein  33.59 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0000870155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  31.17 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.216525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>