13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1841 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1841  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.644348  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3331  hypothetical protein  76 
 
 		 52 aa  60.1  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2168  hypothetical protein  63.89 
 
 		 50 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2300  hypothetical protein  56.76 
 
 		 50 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78628  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5076  hypothetical protein  72.55 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4156  hypothetical protein  58.82 
 
 		 51 aa  41.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5990  hypothetical protein  74 
 
 		 52 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5022  hypothetical protein  68.63 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105589  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5838  hypothetical protein  68.63 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4341  hypothetical protein  68.63 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3216  hypothetical protein  70.59 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.965485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2140  hypothetical protein  62.75 
 
 		 52 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.635933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2127  hypothetical protein  62.75 
 
 		 52 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071292  normal  0.529379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>