12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2092 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2092  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39260  hypothetical protein  30.99 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.315069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2594  hypothetical protein  26.98 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4126  hypothetical protein  31.11 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2966  hypothetical protein  28.3 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2927  hypothetical protein  26.02 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3434  hypothetical protein  27.54 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0556615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3088  hypothetical protein  27.54 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2854  hypothetical protein  25.31 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.512185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2835  hypothetical protein  25.73 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2766  hypothetical protein  27.8 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2961  hypothetical protein  27.91 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0973815  normal  0.781678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>