30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6482 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6482  virulence protein SrfB  100 
 
 		 1048 aa  2175    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0470  virulence protein SrfB  31.36 
 
 		 1000 aa  388  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4239  virulence protein SrfB  30.6 
 
 		 1000 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2632  virulence protein SrfB  30.67 
 
 		 1044 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.623195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2871  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1044 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52090  hypothetical protein  31.82 
 
 		 992 aa  376  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1313  virulence factor SrfB-like protein  30.99 
 
 		 1036 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3154  hypothetical protein  31.02 
 
 		 993 aa  366  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.30642  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1709  virulence protein SrfB  29.55 
 
 		 993 aa  347  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1712  virulence protein SrfB  29.46 
 
 		 993 aa  346  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2109  virulence protein SrfB  29.32 
 
 		 993 aa  345  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1566  virulence protein SrfB  29.46 
 
 		 993 aa  344  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.823683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1747  virulence protein SrfB  29.46 
 
 		 993 aa  344  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.841748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1774  virulence protein SrfB  29.46 
 
 		 993 aa  344  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.513722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1845  hypothetical protein  30.66 
 
 		 996 aa  344  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90632  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0897  virulence protein SrfB  27.69 
 
 		 1041 aa  343  8e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.112933  normal  0.362744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1881  virulence protein SrfB  29.52 
 
 		 995 aa  343  8e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0611287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2094  virulence protein SrfB  29.14 
 
 		 995 aa  341  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.125719  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1964  virulence protein SrfB  29.84 
 
 		 1042 aa  341  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2382  virulence protein SrfB  29.57 
 
 		 995 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4052  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1020 aa  337  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0348037  normal  0.215609 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3216  virulence factor SrfB-like protein  29.3 
 
 		 996 aa  328  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.952482 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2101  virulence protein SrfB  29.53 
 
 		 996 aa  327  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485663  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1843  putative virulence factor SrfB  28.39 
 
 		 1023 aa  314  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1434  virulence protein SrfB  28.33 
 
 		 981 aa  310  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2281  SrfB superfamily virulence factor  27.64 
 
 		 987 aa  293  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1953  putative virulence factor SrfB  27.51 
 
 		 383 aa  125  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1385  molecular chaperone Hsp70 family  30.93 
 
 		 430 aa  48.1  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  32.99 
 
 		 430 aa  48.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  29.47 
 
 		 430 aa  45.8  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>