13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5817 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5817  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901001  normal  0.458835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0255  protein of unknown function DUF820  35.14 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0531  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332482  normal  0.0502942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1187  protein of unknown function DUF820  43.64 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3948  hypothetical protein  35.62 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1609  protein of unknown function DUF820  28.81 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  25.69 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3923  protein of unknown function DUF820  31.09 
 
 		 191 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  25.17 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  34.55 
 
 		 187 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1833  hypothetical protein  34.29 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  28.3 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>