19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5702 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5702  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 158 aa  324  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1710  fatty acid hydroxylase  48.68 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  0.199306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4535  carotene hydroxylase  45.03 
 
 		 168 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2089  fatty acid hydroxylase  46.85 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.213926  normal  0.0390398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5618  fatty acid hydroxylase  46.94 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2033  fatty acid hydroxylase  44.44 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0059  carotene hydroxylase  44.52 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2038  beta-carotene hydroxylase  46.05 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0223903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1168  carotene hydroxylase  43.48 
 
 		 176 aa  127  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2128  carotene hydroxylase  42.95 
 
 		 200 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2665  fatty acid hydroxylase  40.13 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2516  carotene hydroxylase  40.76 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3246  beta-carotene hydroxylase  40.13 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00925  beta carotene hydroxylase  41.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2647  fatty acid hydroxylase  38.85 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.810487  normal  0.467325 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0702  fatty acid hydroxylase  36 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1074  carotene hydroxylase  38.06 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0482  fatty acid hydroxylase  37.9 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_9013  predicted protein  36.36 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252602  normal  0.0220603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>