17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5697 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5697  Glycogen(starch) synthase  100 
 
 		 606 aa  1266    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3735  Glycogen (starch) synthase  73.1 
 
 		 604 aa  956    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1581  glycogen synthase, glycosyltransferase family 3 protein  60.44 
 
 		 604 aa  774    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0619337  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81231  glycogen (starch) synthase  44.94 
 
 		 699 aa  511  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490915  normal  0.0297098 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00590  glycogen (starch) synthase, putative  44.26 
 
 		 733 aa  508  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08010  glycogen synthase (Eurofung)  43.33 
 
 		 711 aa  504  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53633  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  29.03 
 
 		 1413 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  28.88 
 
 		 1421 aa  250  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1042  glycogen synthase, putative  28.29 
 
 		 548 aa  217  5.9999999999999996e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0023004 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1552  glycogen synthase  23.11 
 
 		 594 aa  102  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.575386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0296  hypothetical protein  22.33 
 
 		 603 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0433  hypothetical protein  22.7 
 
 		 601 aa  60.1  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.430655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 395 aa  48.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 408 aa  47.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 395 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 410 aa  44.3  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>