15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4705 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 414 aa  851    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  26.44 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  25.91 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  25.99 
 
 		 466 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  28.08 
 
 		 491 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3397  Lanthionine synthetase C family protein  23.08 
 
 		 391 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  25.33 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  25.49 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 713 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  27.11 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  27.65 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  24.4 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  24.79 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  27.23 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  24.55 
 
 		 367 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>