28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3515 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3515  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  254  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6309  hypothetical protein  65.85 
 
 
127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2150  hypothetical protein  64.23 
 
 
127 aa  168  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252745  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2277  hypothetical protein  57.38 
 
 
127 aa  152  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2565  hypothetical protein  52.85 
 
 
127 aa  150  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0147  hypothetical protein  58.2 
 
 
128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2530  hypothetical protein  51.24 
 
 
136 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1550  hypothetical protein  49.59 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.3108  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3203  hypothetical protein  53.33 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00257301  normal  0.651911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1968  hypothetical protein  50.41 
 
 
125 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3618  hypothetical protein  47.97 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0549643  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1590  hypothetical protein  45.53 
 
 
133 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.500366  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5503  hypothetical protein  48.36 
 
 
132 aa  114  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125578  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3367  hypothetical protein  49.11 
 
 
133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0087  hypothetical protein  43.33 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.193229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1065  hypothetical protein  49.54 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2347  hypothetical protein  43.33 
 
 
130 aa  114  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1794  hypothetical protein  51.67 
 
 
136 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1723  hypothetical protein  51.67 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2155  hypothetical protein  51.67 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1957  hypothetical protein  47.93 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127418  hitchhiker  0.00000331602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1809  hypothetical protein  40.5 
 
 
150 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1634  hypothetical protein  45 
 
 
134 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2572  hypothetical protein  41.46 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486576  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13590  hypothetical protein  40.48 
 
 
162 aa  90.1  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.486672  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1121  hypothetical protein  35.29 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705516  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0582  hypothetical protein  33.59 
 
 
283 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0323  hypothetical protein  26.83 
 
 
271 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>