16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2866 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2866  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11403  hypothetical protein  33.74 
 
 
296 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.306099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2539  hypothetical protein  32.99 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2479  hypothetical protein  32.32 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.322617  normal  0.362973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1216  hypothetical protein  30.04 
 
 
302 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.256676  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1412  hypothetical protein  27.08 
 
 
282 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0932  hypothetical protein  30.2 
 
 
303 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0973643 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0819  hypothetical protein  29.88 
 
 
302 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3751  hypothetical protein  30.34 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1201  hypothetical protein  27.32 
 
 
245 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.800385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  24.39 
 
 
312 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  23.53 
 
 
302 aa  49.3  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  30.25 
 
 
751 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  29.41 
 
 
348 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  28.32 
 
 
321 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  24.91 
 
 
305 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>