12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1431 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1431  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  604  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2483  membrane protein containing DUF6  42.95 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.886177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2510  hypothetical protein  34.21 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12723  hypothetical protein  28.62 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7126  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 288 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.755088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4335  hypothetical protein  29.21 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.723653  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0109  hypothetical protein  25.89 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0476827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0091  hypothetical protein  28.05 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0084  hypothetical protein  25.83 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.773078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0867  permease  26.69 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1090  integral membrane protein  22.18 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>