12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24460  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  639    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.760342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1109  hypothetical protein  44.97 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334333  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1387  hypothetical protein  45.54 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3222  hypothetical protein  35.91 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1107  hypothetical protein  37.25 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1210  hypothetical protein  30.39 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0200595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03580  hypothetical protein  31.63 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0108  hypothetical protein  31.79 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1273  hypothetical protein  37.76 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0050  hypothetical protein  27.97 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4240  NADH dehydrogenase (quinone)  35.34 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05080  hypothetical protein  27.78 
 
 		 151 aa  43.1  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.730131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>