17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_22060  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  240  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.873506  normal  0.803324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22570  hypothetical protein  54 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6244  hypothetical protein  55.29 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92011  normal  0.196222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1960  hypothetical protein  45.05 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1812  hypothetical protein  55.56 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00409848  normal  0.984143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2405  hypothetical protein  27.45 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.45 
 
 
495 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5052  hypothetical protein  35.16 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  23.77 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  29.47 
 
 
126 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2382  hypothetical protein  25.93 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79559  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  29.47 
 
 
126 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  23.77 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  25.23 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  24.37 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  25.23 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3728  hypothetical protein  38.32 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.871403  normal  0.0222749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>