31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  39.51 
 
 		 210 aa  121  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  38.6 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  38.61 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  38.89 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  37.37 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  36.97 
 
 		 238 aa  104  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  38.02 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  36.92 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  36.18 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  34.76 
 
 		 220 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  35.68 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  35.68 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  35.82 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  39.57 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  33.97 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  32.67 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  36.55 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  34.87 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  35.2 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  38.46 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  30.92 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  31.68 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  32.66 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  31.13 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  35.86 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  29.69 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  34.9 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  32.02 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  31.12 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.429032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>