32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04280  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  155  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3199  hypothetical protein  47.76 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000230213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0260  hypothetical protein  43.18 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26160  hypothetical protein  38.96 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0485  hypothetical protein  46.88 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17500  hypothetical protein  40.3 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0980  hypothetical protein  38.03 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0299177  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  38.57 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2357  hypothetical protein  47.37 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1804  hypothetical protein  48.15 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  30.59 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  32.95 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6840  secreted protein  33.78 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1190  hypothetical protein  35.62 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0934  hypothetical protein  45.83 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.860281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  53.49 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2724  hypothetical protein  42.37 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1316  hypothetical protein  43.75 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3451  hypothetical protein  36.92 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3503  hypothetical protein  36.92 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138277  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3440  hypothetical protein  36.92 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.110215  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3812  hypothetical protein  40.68 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.285278  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6546  hypothetical protein  44.23 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240638  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6639  hypothetical protein  40.28 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3420  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3797  hypothetical protein  39.62 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1937  hypothetical protein  45.45 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20896  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13830  hypothetical protein  46 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381398  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1677  hypothetical protein  52.78 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.989943  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.795101  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2738  hypothetical protein  42.31 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3221  hypothetical protein  39.29 
 
 		 113 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0124684  normal  0.80653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>