15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3892 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3892  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  352  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0146  hypothetical protein  32.22 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2554  hypothetical protein  32.22 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4017  hypothetical protein  28.49 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4272  hypothetical protein  24.85 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4411  hypothetical protein  24.85 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06216  hypothetical protein  27.91 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4177  hypothetical protein  26.97 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3838  hypothetical protein  23.84 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2282  hypothetical protein  25.84 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1892  hypothetical protein  24.71 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3458  hypothetical protein  24.71 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3419  hypothetical protein  28.24 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.735509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4197  hypothetical protein  18.79 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0961  hypothetical protein  24.24 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>