33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3790 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3790  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.973838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3719  twin-arginine translocation pathway signal  98.46 
 
 		 65 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4508  hypothetical protein  96.92 
 
 		 65 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3915  hypothetical protein  96.92 
 
 		 65 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0338  hypothetical protein  89.23 
 
 		 76 aa  97.1  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4135  hypothetical protein  87.69 
 
 		 65 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4105  formate dehydrogenase region TAT target  87.69 
 
 		 65 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0234  formate dehydrogenase region TAT target  86.15 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4223  formate dehydrogenase region TAT target  86.15 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4422  twin-arginine translocation pathway signal  75.38 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4814  formate dehydrogenase region TAT target  72.31 
 
 		 65 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.668008 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4138  formate dehydrogenase region TAT target  67.69 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0056  twin-arginine translocation pathway signal  73.02 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0058  twin-arginine translocation pathway signal  76.19 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0334  twin-arginine translocation pathway signal  46.97 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0062  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4139  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4109  formate dehydrogenase region TAT target  45.45 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0230  formate dehydrogenase region TAT target  45.45 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4227  formate dehydrogenase region TAT target  45.45 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3610  hypothetical protein  43.08 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3794  twin-arginine translocation pathway signal  43.94 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3723  twin-arginine translocation pathway signal  43.94 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4810  formate dehydrogenase region TAT target  48.57 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3919  hypothetical protein  43.94 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4418  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4130  formate dehydrogenase region TAT target  46.88 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3614  hypothetical protein  49.23 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4134  formate dehydrogenase region TAT target  38.1 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1452  hypothetical protein  47.69 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02276  hypothetical protein  48.21 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003495  hypothetical protein  46.43 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4512  hypothetical protein  43.94 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>