22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3438 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3438  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0592  hypothetical protein  98.68 
 
 
151 aa  306  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396305  hitchhiker  0.00000978243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0591  hypothetical protein  98.68 
 
 
151 aa  306  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0595  hypothetical protein  98.68 
 
 
183 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3286  hypothetical protein  93.38 
 
 
151 aa  288  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0978645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3716  hypothetical protein  92.05 
 
 
151 aa  286  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3899  hypothetical protein  92.05 
 
 
151 aa  286  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0004514  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0552  hypothetical protein  92.05 
 
 
151 aa  286  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3773  hypothetical protein  92.05 
 
 
151 aa  286  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3031  hypothetical protein  73.51 
 
 
151 aa  239  9e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3316  hypothetical protein  66.23 
 
 
151 aa  216  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3546  hypothetical protein  66.23 
 
 
151 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0791  hypothetical protein  67.55 
 
 
151 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254088 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4177  hypothetical protein  64.9 
 
 
170 aa  207  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0560  hypothetical protein  60.93 
 
 
151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.312654  normal  0.199565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3210  hypothetical protein  52.32 
 
 
151 aa  154  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000480541  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0007  hypothetical protein  30.15 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.250623  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2338  hypothetical protein  21.25 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0351518  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2125  hypothetical protein  21.25 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000810888  normal  0.58811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2877  hypothetical protein  34.72 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2137  hypothetical protein  23.26 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.788442  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1939  ATPase  20.13 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>