22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0718 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0718  phage transcriptional activator, Ogr/delta  100 
 
 		 82 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1278  phage transcriptional activator, Ogr/delta  80.49 
 
 		 82 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05018  hypothetical protein  62.5 
 
 		 83 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2939  zinc-finger protein  55.41 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  6.930430000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0692  phage transcriptional activator, Ogr/delta  53.25 
 
 		 81 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0895  transcriptional activator Ogr/delta  49.38 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.646461  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1024  phage zinc-binding transcriptional activator  54.88 
 
 		 154 aa  87  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2802  zinc-finger protein  47.3 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0358  phage transcriptional activator Ogr/delta  37.5 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0237  transcriptional activator Ogr/delta  43.04 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000439463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1475  phage transcriptional activator, Ogr/delta  45.45 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0527212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2769  phage transcriptional activator, Ogr/delta  53.7 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278918  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  42.19 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1062  zinc-finger protein  63.16 
 
 		 42 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  42.19 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0359  zinc-finger protein  33.33 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  41.67 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0173  transcriptional activator Ogr/delta  34.21 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4868  transcriptional activator Ogr/delta  35.53 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.547602  normal  0.181017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1628  transcriptional activator Ogr/delta  31.25 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2617  transcriptional activator Ogr/delta  30 
 
 		 107 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00204522  hitchhiker  0.000000000237412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2583  transcriptional activator Ogr/delta  30 
 
 		 107 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206926  hitchhiker  0.0000460899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>