33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3719 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3719  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3790  twin-arginine translocation pathway signal  98.46 
 
 		 65 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.973838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4508  hypothetical protein  98.46 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3915  hypothetical protein  98.46 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0338  hypothetical protein  87.69 
 
 		 76 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4135  hypothetical protein  86.15 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4105  formate dehydrogenase region TAT target  86.15 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0234  formate dehydrogenase region TAT target  84.62 
 
 		 65 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4223  formate dehydrogenase region TAT target  84.62 
 
 		 65 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4422  twin-arginine translocation pathway signal  76.92 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4814  formate dehydrogenase region TAT target  73.85 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.668008 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4138  formate dehydrogenase region TAT target  67.69 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0058  twin-arginine translocation pathway signal  77.78 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0056  twin-arginine translocation pathway signal  73.02 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0334  twin-arginine translocation pathway signal  46.97 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0062  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4109  formate dehydrogenase region TAT target  45.45 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3610  hypothetical protein  43.08 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4139  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0230  formate dehydrogenase region TAT target  45.45 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4418  hypothetical protein  51.56 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4810  formate dehydrogenase region TAT target  50 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4227  formate dehydrogenase region TAT target  45.45 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3614  hypothetical protein  50.77 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3794  twin-arginine translocation pathway signal  43.94 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3723  twin-arginine translocation pathway signal  43.94 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3919  hypothetical protein  43.94 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4130  formate dehydrogenase region TAT target  45.31 
 
 		 65 aa  48.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1452  hypothetical protein  49.23 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4134  formate dehydrogenase region TAT target  43.75 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02276  hypothetical protein  48.21 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003495  hypothetical protein  46.43 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4512  hypothetical protein  43.94 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>