14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3075 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3731  hypothetical protein  84.66 
 
 		 515 aa  906    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3075  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1044    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0733836  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0897  hypothetical protein  97.67 
 
 		 515 aa  1021    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0860  hypothetical protein  93.79 
 
 		 515 aa  980    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.258003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3411  hypothetical protein  66.73 
 
 		 518 aa  687    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3046  peptidase S41  62.6 
 
 		 521 aa  661    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.854306  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0925  hypothetical protein  66.86 
 
 		 520 aa  691    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0959  hypothetical protein  66.86 
 
 		 520 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.628982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0951  hypothetical protein  66.28 
 
 		 520 aa  689    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0785  peptidase S41  34.78 
 
 		 485 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3798  hypothetical protein  33.52 
 
 		 514 aa  292  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2894  hypothetical protein  34.25 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0670  hypothetical protein  31.38 
 
 		 488 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000436312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0660  hypothetical protein  27.52 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>