55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2978 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2978  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  430  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.294635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3060  hypothetical protein  99.02 
 
 		 205 aa  427  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3158  hypothetical protein  98.53 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3557  hypothetical protein  94.12 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3258  hypothetical protein  91.04 
 
 		 217 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.077733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1033  hypothetical protein  91.04 
 
 		 217 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.935593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1100  hypothetical protein  90.05 
 
 		 217 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1038  hypothetical protein  89.27 
 
 		 205 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1134  hypothetical protein  90.05 
 
 		 217 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3324  hypothetical protein  83.9 
 
 		 205 aa  371  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1331  hypothetical protein  85.22 
 
 		 205 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1229  hypothetical protein  83.9 
 
 		 205 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1210  hypothetical protein  81.64 
 
 		 205 aa  360  6e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1074  hypothetical protein  81.86 
 
 		 205 aa  359  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1060  hypothetical protein  87.7 
 
 		 203 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1221  hypothetical protein  80.85 
 
 		 228 aa  333  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3372  putative lipoprotein  69.12 
 
 		 204 aa  292  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4077  putative lipoprotein  67 
 
 		 206 aa  290  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1367  putative lipoprotein  64.47 
 
 		 218 aa  270  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02762  putative lipoprotein  63.32 
 
 		 212 aa  254  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0691373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3012  transcriptional regulatory protein  59.24 
 
 		 198 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2633  hypothetical protein  56.5 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002531  hypothetical protein  53.72 
 
 		 188 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03485  hypothetical protein  53.76 
 
 		 187 aa  214  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0644  putative lipoprotein  49.49 
 
 		 199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2668  hypothetical protein  46.81 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0580276  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1365  hypothetical protein  46.39 
 
 		 198 aa  181  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1944  hypothetical protein  44.56 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0808013  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1361  hypothetical protein  45.88 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3447  putative lipoprotein  45.55 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.002618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0430  putative lipoprotein  44.68 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1496  hypothetical protein  43.68 
 
 		 193 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0147  hypothetical protein  43.68 
 
 		 193 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.126883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0062  hypothetical protein  46.86 
 
 		 195 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0191236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2902  hypothetical protein  42.63 
 
 		 193 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1882  transcriptional regulatory protein  49.25 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.622701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2832  transcriptional regulatory protein  42.5 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000741342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0984  hypothetical protein  41.57 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00101229  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2230  hypothetical protein  40.8 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0068  lipoprotein  46.35 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2173  hypothetical protein  41.44 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780723  normal  0.253338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1048  hypothetical protein  40.98 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0710  putative lipoprotein  41.14 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147777  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0021  hypothetical protein  40.11 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1984  lytic transglycosylase catalytic  40.96 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0234  hypothetical protein  42.02 
 
 		 193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2157  hypothetical protein  39.57 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.563893  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1317  putative lipoprotein  38.71 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1168  putative lipoprotein  40.84 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0204  hypothetical protein  41.49 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1205  putative lipoprotein  40.84 
 
 		 194 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2885  hypothetical protein  38.1 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0501836  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1881  hypothetical protein  40.68 
 
 		 190 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3587  hypothetical protein  41.48 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2221  putative transmembrane protein  39.44 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  0.348957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>