33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3877 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0230  hypothetical protein  58.25 
 
 		 569 aa  688    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.769697  normal  0.583487 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3984  hypothetical protein  83.76 
 
 		 548 aa  967    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0379  hypothetical protein  60.31 
 
 		 543 aa  678    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4180  hypothetical protein  83.76 
 
 		 548 aa  969    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0276  hypothetical protein  61.14 
 
 		 561 aa  694    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4221  hypothetical protein  64.51 
 
 		 517 aa  705    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.256943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4062  hypothetical protein  83.76 
 
 		 548 aa  970    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3685  hypothetical protein  77.6 
 
 		 549 aa  928    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4093  hypothetical protein  84.12 
 
 		 548 aa  972    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245434  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3352  hypothetical protein  61.24 
 
 		 546 aa  705    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3877  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1136    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.413132  normal  0.0515255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0393  hypothetical protein  59.85 
 
 		 559 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0272  hypothetical protein  97.07 
 
 		 546 aa  1106    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3673  hypothetical protein  96.89 
 
 		 546 aa  1104    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3442  hypothetical protein  56.6 
 
 		 550 aa  658    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.325746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0306  hypothetical protein  88.67 
 
 		 503 aa  951    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0927  hypothetical protein  36.29 
 
 		 608 aa  302  8.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.943956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0256  hypothetical protein  29.07 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.17253  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0286  hypothetical protein  27.98 
 
 		 546 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399443  hitchhiker  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2958  hypothetical protein  28.4 
 
 		 609 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4071  hypothetical protein  35.24 
 
 		 640 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184175  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2475  hypothetical protein  23.57 
 
 		 611 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.641856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1656  hypothetical protein  30.46 
 
 		 627 aa  57.8  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.558221  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0364  hypothetical protein  25.26 
 
 		 683 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0339  hypothetical protein  30.61 
 
 		 639 aa  50.4  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.809143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.86 
 
 		 829 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  24.16 
 
 		 834 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.6 
 
 		 821 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.19 
 
 		 857 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.6 
 
 		 855 aa  45.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.52 
 
 		 854 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.52 
 
 		 864 aa  43.5  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.52 
 
 		 854 aa  43.5  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>