23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1279 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1279  putative lipoprotein  100 
 
 		 87 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2347  putative lipoprotein  72.41 
 
 		 88 aa  137  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.629232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2001  putative lipoprotein  70.11 
 
 		 88 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2915  putative lipoprotein  68.48 
 
 		 92 aa  134  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1547  hypothetical protein  67.39 
 
 		 92 aa  129  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175171  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1892  putative lipoprotein  66.3 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3722  putative lipoprotein  64.13 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35750  lipoprotein  65.91 
 
 		 88 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2587  lipoprotein  75.86 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2063  putative lipoprotein  65.52 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3709  putative lipoprotein  64.37 
 
 		 87 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1337  hypothetical protein  59.78 
 
 		 92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0469662  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35840  lipoprotein  66.67 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300503  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0723  putative lipoprotein  69.32 
 
 		 88 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0809  hypothetical protein  55.17 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.910435  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4192  hypothetical protein  60.47 
 
 		 80 aa  94  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0332  putative lipoprotein  62.75 
 
 		 59 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.907733  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3509  hypothetical protein  47.95 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0441  hypothetical protein  45.71 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1315  hypothetical protein  46.58 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2642  hypothetical protein  47.3 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2906  putative lipoprotein  41.27 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2702  putative lipoprotein  58.54 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>