15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1409 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1409  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  772    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  hitchhiker  0.0084702 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1607  hypothetical protein  32.84 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3682  hypothetical protein  30.24 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00939506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1362  hypothetical protein  28.31 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0609018  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0298  hypothetical protein  23.86 
 
 		 367 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2549  hypothetical protein  29.38 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0060  hypothetical protein  27.46 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0960  putative WfaX  27.42 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0140  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  27.05 
 
 		 867 aa  89.4  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.0838e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2618  hypothetical protein  25.65 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.568711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1786  hypothetical protein  26.64 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2095  hypothetical protein  24.94 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3879  hypothetical protein  25.54 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2894  hypothetical protein  27.96 
 
 		 329 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  26.34 
 
 		 867 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>