15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2402 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2402  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  858    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1693  hypothetical protein  42.96 
 
 
315 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2840  hypothetical protein  46.3 
 
 
329 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4937  hypothetical protein  36.09 
 
 
336 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0259  hypothetical protein  35.66 
 
 
293 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2162  hypothetical protein  39.81 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0873  hypothetical protein  30.6 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3571  hypothetical protein  34.29 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0747  hypothetical protein  22.69 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.509799 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00430  hypothetical protein  30.99 
 
 
936 aa  70.5  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0265  hypothetical protein  42.86 
 
 
154 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0164  hypothetical protein  30 
 
 
936 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3763  hypothetical protein  30.63 
 
 
444 aa  61.6  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493237  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0433  hypothetical protein  29.2 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5757  hypothetical protein  26.85 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>