14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3181 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3181  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  557  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0866  hypothetical protein  34.53 
 
 
290 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17753  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3723  hypothetical protein  28.72 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2212  hypothetical protein  28.28 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.522693 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5496  hypothetical protein  30.48 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4870  hypothetical protein  25.87 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.287661  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3316  hypothetical protein  24.62 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5292  hypothetical protein  29.53 
 
 
199 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5566  hypothetical protein  29.53 
 
 
199 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3022  hypothetical protein  25 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689428  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5344  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1932  hypothetical protein  27.59 
 
 
277 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.633119  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5223  hypothetical protein  25.52 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1366  hypothetical protein  25.25 
 
 
289 aa  42.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>