13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2250 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2250  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  627  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.741825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1397  hypothetical protein  38.41 
 
 
337 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.237722  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2057  hypothetical protein  38.63 
 
 
341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01305  WalW protein  27.69 
 
 
333 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4831  WalW protein  27.22 
 
 
318 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.608303  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1349  hypothetical protein  25.76 
 
 
336 aa  89  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3309  hypothetical protein  25.17 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1196  hypothetical protein  29.35 
 
 
335 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1286  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6503  WalW protein  27.74 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3081  hypothetical protein  24.37 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1802  hypothetical protein  27.76 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
770 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>