22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1925 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1925  hypothetical protein  100 
 
 
788 aa  1602    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  hitchhiker  0.0041869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1575  hypothetical protein  30.03 
 
 
757 aa  278  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00365825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  26.49 
 
 
1219 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  26.82 
 
 
1219 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  26.64 
 
 
1219 aa  72  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  26.16 
 
 
1219 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  25.68 
 
 
1219 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  25.68 
 
 
1219 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  25.68 
 
 
1219 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  25.68 
 
 
1219 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  25.68 
 
 
1219 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  25.81 
 
 
1145 aa  70.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  25.83 
 
 
1219 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.83 
 
 
1219 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  24.04 
 
 
1146 aa  64.7  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  24.04 
 
 
1146 aa  64.7  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  21.29 
 
 
1228 aa  64.7  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  26.83 
 
 
648 aa  58.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  20.62 
 
 
1249 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  25 
 
 
614 aa  45.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  25 
 
 
614 aa  45.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  43.75 
 
 
292 aa  45.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>