16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3999 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3999  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3711  hypothetical protein  76.56 
 
 		 64 aa  100  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2847  hypothetical protein  60.94 
 
 		 64 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2672  hypothetical protein  60.94 
 
 		 64 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2740  hypothetical protein  60.94 
 
 		 64 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4136  hypothetical protein  62.5 
 
 		 64 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1420  hypothetical protein  65.62 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1412  hypothetical protein  65.62 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1446  hypothetical protein  65.62 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2934  hypothetical protein  65.62 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1321  hypothetical protein  62.5 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01266  hypothetical protein  73.81 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.204518  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001939  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1490  hypothetical protein  36.36 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169523  hitchhiker  0.000314607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0265  hypothetical protein  53.06 
 
 		 55 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0107016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1578  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>