14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3493 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3493  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  36.02 
 
 		 502 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4031  hypothetical protein  34.58 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0211  hypothetical protein  34.58 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0186  hypothetical protein  36.19 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0214  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2726  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 226 aa  97.8  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2982  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 226 aa  97.8  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2917  hypothetical protein  30.95 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3889  hypothetical protein  30.48 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3808  hypothetical protein  30.62 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0034  hypothetical protein  24.88 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4377  hypothetical protein  23.71 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0627  hypothetical protein  23.71 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>