61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0423 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0423  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  100 
 
 		 85 aa  173  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4030  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  71.76 
 
 		 85 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4127  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  71.76 
 
 		 85 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4008  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  71.76 
 
 		 85 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3933  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  71.76 
 
 		 85 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3613  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  70.59 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0363  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  75 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0357  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  75 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3663  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  75 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4346  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  71.25 
 
 		 86 aa  120  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3413  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  67.11 
 
 		 93 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0290  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  58.97 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4164  acetolactate synthase small subunit  55 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0346  amino acid-binding ACT domain-containing protein  55.26 
 
 		 88 aa  95.9  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.550945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0443  amino acid-binding ACT domain-containing protein  59.15 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.886591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4127  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  41.46 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4184  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  41.46 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4233  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  41.46 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.594626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4112  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  41.46 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4292  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  41.46 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0139  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.75 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4220  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  52.24 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4031  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  52.24 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.612763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4207  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  40.24 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4151  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  40.24 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4135  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  40.24 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.683239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5203  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  40.24 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4233  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  40.24 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.196128  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03596  hypothetical protein  40.24 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0138992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3986  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  40.24 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03647  acetolactate synthase II, small subunit  40.24 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4280  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  40.24 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0155  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  47.95 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0483  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  47.95 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.242348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4060  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  47.95 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4014  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  39.02 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4759  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  49.3 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0054  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  45.83 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3775  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  47.06 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3280  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  61.04 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002040  acetolactate synthase small subunit  41.89 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0347  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.44 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2489  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  44.78 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00411  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  41.1 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0148  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  49.3 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4844  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  40.28 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  38.57 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.75 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  33.77 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  38.57 
 
 		 161 aa  42.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  35.06 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2115  hypothetical protein  31.51 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  32.43 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.5 
 
 		 172 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.33 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.33 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  30.77 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3229  acetolactate synthase, small subunit  34.52 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1907  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.29 
 
 		 172 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.29 
 
 		 172 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1887  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.29 
 
 		 172 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00850496  normal  0.0767808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>