14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4574 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4665  integrase, catalytic region  98.09 
 
 		 468 bp  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4574    100 
 
 		 480 bp  952    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176839  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  84.11 
 
 		 1041 bp  77.8  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0914    84.11 
 
 		 2410 bp  77.8  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  84.11 
 
 		 1041 bp  77.8  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  84.11 
 
 		 1041 bp  77.8  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  84.11 
 
 		 1041 bp  77.8  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  86.76 
 
 		 372 bp  63.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  86.76 
 
 		 372 bp  63.9  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0539    86.76 
 
 		 372 bp  63.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0603    86.76 
 
 		 372 bp  63.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  86.76 
 
 		 372 bp  63.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0436    88.68 
 
 		 372 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.115653  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  90.24 
 
 		 1041 bp  50.1  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>