27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3545 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



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Alignment on homolog gene

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3545  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  100 
 
 
80 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3713  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  95 
 
 
80 aa  149  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3544  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  92.5 
 
 
80 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0062  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  91.03 
 
 
79 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  91.03 
 
 
79 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  91.03 
 
 
79 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.493404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3651  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  94.12 
 
 
80 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3616  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  93.75 
 
 
80 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.384488  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0060  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  88.41 
 
 
79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0063  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  89.74 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0830  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  83.82 
 
 
68 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0802  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  83.08 
 
 
69 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0893  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  78.12 
 
 
68 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0861  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  80 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0201  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  48.75 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.41736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3624  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  49.33 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000194054  decreased coverage  0.0000000418029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0692  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  48.05 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1260  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase gamma subunit  40 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.406933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002524  oxaloacetate decarboxylase gamma chain  38.27 
 
 
85 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0628389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1305  ribonuclease D  43.42 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00021107  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03492  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  38.27 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0321  putative oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  36.47 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3195  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  38.96 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.139992  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0970  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  42.25 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0638  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  39.24 
 
 
83 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.471241  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A0084  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  37.5 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000518126  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_2894  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  39.02 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11111  normal  0.988078 
 
 
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