16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0204 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0204  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0646663  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3971  fimbrial protein  51.89 
 
 
197 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3523  fimbrial protein  44.39 
 
 
196 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.244973  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0145  fimbrial protein  42.02 
 
 
196 aa  141  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.751304  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0147  putative fimbrial protein  38.54 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00135  predicted fimbrial-like adhesin protein  37.29 
 
 
198 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.414874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0140  hypothetical protein  37.29 
 
 
198 aa  120  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0281116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0139  hypothetical protein  37.29 
 
 
198 aa  120  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3466  putative fimbrial protein  37.08 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0206  putative fimbrial protein  36.79 
 
 
199 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00134  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  27.03 
 
 
181 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  27.03 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  27.03 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  27.03 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  27.03 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>