48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0044 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  97.52 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  34.33 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  32.28 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  35.53 
 
 		 303 aa  148  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  35.59 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  35.59 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  35.59 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  35.59 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  35.59 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  38.66 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  34.41 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  35.17 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  34.41 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  33.33 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  33.09 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  34.72 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  37.35 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  31.43 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  37.85 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  38.1 
 
 		 317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  38.58 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  34.87 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  34.87 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  36.11 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  34.45 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  34.45 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  34.45 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  35.66 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  33.47 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  32.74 
 
 		 329 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  32.74 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  31.36 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  31.82 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  32.68 
 
 		 306 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  31.78 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  33.75 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  31.91 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  31.78 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  30.64 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  27.33 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  26.18 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  28.75 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  28.11 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1215  inner membrane protein  23.4 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  29.46 
 
 		 751 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>