16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3711 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3711  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3999  hypothetical protein  76.56 
 
 
64 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2672  hypothetical protein  68.75 
 
 
64 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2740  hypothetical protein  68.75 
 
 
64 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2847  hypothetical protein  68.75 
 
 
64 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4136  hypothetical protein  54.69 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1321  hypothetical protein  70.31 
 
 
64 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1420  hypothetical protein  71.88 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1412  hypothetical protein  71.88 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1446  hypothetical protein  71.88 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2934  hypothetical protein  71.88 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380988  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01266  hypothetical protein  71.43 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.204518  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001939  hypothetical protein  43.08 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0265  hypothetical protein  55.32 
 
 
55 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0107016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1578  hypothetical protein  41.07 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1490  hypothetical protein  54.29 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169523  hitchhiker  0.000314607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>