20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3275 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3275  GP46  100 
 
 		 107 aa  223  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000845593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2002  GP46  46.73 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00138731  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0728  GP46  45.71 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00505701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3271  GP46  47.47 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0758  GP46  45.79 
 
 		 106 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00217936  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3507  GP46  44.86 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0774755  hitchhiker  0.00450512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1960  GP46  47.52 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  0.0379275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2575  GP46  45.28 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.029841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3382  GP46  44.76 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000163706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1845  GP46  44.23 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00167765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1953  GP46  44.44 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000678855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3408  GP46  42.86 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559716  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4295  hypothetical protein  42.42 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2829  hypothetical protein  37.14 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.705107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4440  hypothetical protein  34 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1656  hypothetical protein  29.13 
 
 		 521 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1015  gp41  31 
 
 		 223 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1661  hypothetical protein  32 
 
 		 221 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0089  hypothetical protein  33.02 
 
 		 214 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2204  hypothetical protein  30.61 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000075026  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>