16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2177 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2177  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0567  hypothetical protein  33.46 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0190057  hitchhiker  0.00000419669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  34.04 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  31.19 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  32.11 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  29.79 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  26.92 
 
 		 342 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  26.92 
 
 		 342 aa  45.8  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  24.7 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.7 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.95 
 
 		 549 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.66 
 
 		 393 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  25 
 
 		 429 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.7 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>