14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0712 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0712  putative permease  100 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0660  putative permease  60 
 
 
81 aa  97.1  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0086  putative permease  59.49 
 
 
80 aa  89.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.117541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1471  hypothetical membrane spanning protein  42.86 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.597407  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0706  hypothetical protein  42.86 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0188915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2656  putative permease  36.25 
 
 
86 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2780  hypothetical protein  36.84 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1325  putative permease  38.96 
 
 
84 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00320  hypothetical protein  35.38 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.520743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4213  hypothetical protein  26.76 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1672  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1673  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.38 
 
 
232 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2581  hypothetical protein  27.14 
 
 
102 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.423852 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5832  hypothetical protein  32.88 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>